Революция в молекулярной биологии, связанная с развитием методов чтения ДНК, особенно с прочтением генома человека в последние годы, привела к бесспорному пониманию того факта, что генетика не может обойтись без математического анализа последовательностей нуклеиновых кислот и белков с целью прочтения, расшифровки и предсказания их функций. Возникшая новая дисциплина – компьютерная генетика, кажется, исполняет эту роль более или менее успешно. Но еще в 1989 году один из разработчиков математических методов в генетике М.С.Уотермен писал, что «одной из нерешенных проблем является создание программного обеспечения для простого доступа к данным. Для пользователя крайне важно уметь обращаться к данным на биологически осмысленном языке. До тех пор, пока это не сделано, пользователи вынуждены писать громоздкие промежуточные процедуры, связывающие их программы анализа и базы данных. В ближайшем будущем мы ожидаем создания одной международной базы данных с системой обработки данных». Прошло с тех пор 12 лет, проблема, кажется, не сдвинулась с места. А вместе с тем объем генетической информации катастрофически возрос, что еще острее ставит проблему, сформулированную М.С.Уотерменом. Смысл нашего семинара заключается в том, чтобы на примере нескольких актуальных задач генной инженерии соединить воедино усилия как биологов и вычислителей, так и математиков других специальностей, чтобы попытаться найти более удовлетворительное решение проблемы создания адекватных математических моделей различных процессов молекулярной биологии, с тем, чтобы на их основе можно было бы создать такое программное обеспечение, которое бы, по словам М.С.Уотермена позволяло «обращаться к данным на биологически осмысленном языке».